Кафедра Богословия была открыта в 2008 г. на базе богословского отделения Санкт-Петербургской духовной академии и семинарии. Первым заведующим кафедры стал протоиерей Владимир Мустафин.
Кафедра обеспечивает учебный процесс в Академии и проводит научную работу по широкому спектру богословских дисциплин: догматическому и нравственному богословию, патрологии, основному богословию, естественнонаучной апологетике, сравнительному богословию и истории западных вероисповеданий, сектоведению, философии, культурологии.
Кафедра богословия осуществляет подготовку студентов бакалавриата по направлениям «Подготовка служителей Русской Православной Церкви», профиль подготовки «Православное практическое богословие», 48.03.01 – «Теология», профиль подготовки «Православная практическая теология»; магистратуры по направлениям «Подготовка служителей Русской Православной Церкви», профиль подготовки «Православное догматическое богословие и патрология».
С 2015 г. заведующим кафедры является священник Дмитрий Лушников.
Преподаватели кафедры, в составе которых 5 докторов и 13 кандидатов наук, руководят научно-исследовательскими работами студентов и аспирантов, организовывают аспирантские и научные семинары, разрабатывают учебные программы дисциплин, в том числе, для дистанционного обучения в системе Moodle, публикуют труды по богословию, философии, апологетике, культуроведению, педагогике.
Кафедра периодически организовывает богословские и научно-практические конференции на актуальные темы церковной науки. Приглашаются на отдельные лекции преподаватели других духовных и светских учебных заведений. На заседаниях кафедры ежемесячно проходят научные семинары, посвященные богословской тематике.
С 2017 года кафедра издает свой научный рецензируемый журнал «Труды кафедры богословия СПбДА», в котором по итогам научных семинаров публикуются материалы и наработки преподавателей и студентов кафедры. Кафедра богословия издает также свою учебно-методическую и научную литературу.
В рамках общецерковного процесса по лицензированию духовных учебных заведений в (2018) г. Санкт-Петербургская духовная академия получила государственную аккредитацию магистратуры. Таким образом, на сегодняшний день выпускники магистерских программ кафедры богословия имеют возможность при выпуске получить диплом государственного образца. На данный момент идет работа по подготовке документов для аккредитации аспирантских программ.